Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POMGNT2Q8NAT1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POMGNT2Q8NAT1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POMGNT2Q8NAT1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POMGNT2Q8NAT1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms