Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNLDC1Q8NA58 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNLDC1Q8NA58 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNLDC1Q8NA58 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms