Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
VWDEQ8N2E2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
VWDEQ8N2E2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
VWDEQ8N2E2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
VWDEQ8N2E2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
VWDEQ8N2E2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
VWDEQ8N2E2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
VWDEQ8N2E2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
VWDEQ8N2E2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
VWDEQ8N2E2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
VWDEQ8N2E2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
VWDEQ8N2E2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38■■■■□ 3.67
VWDEQ8N2E2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
VWDEQ8N2E2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
VWDEQ8N2E2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
VWDEQ8N2E2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
VWDEQ8N2E2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
VWDEQ8N2E2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
VWDEQ8N2E2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
VWDEQ8N2E2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
VWDEQ8N2E2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
VWDEQ8N2E2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
VWDEQ8N2E2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
VWDEQ8N2E2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
VWDEQ8N2E2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
VWDEQ8N2E2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms