Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIRREL3Q8IZU9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIRREL3Q8IZU9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIRREL3Q8IZU9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIRREL3Q8IZU9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIRREL3Q8IZU9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIRREL3Q8IZU9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIRREL3Q8IZU9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIRREL3Q8IZU9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIRREL3Q8IZU9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIRREL3Q8IZU9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIRREL3Q8IZU9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KIRREL3Q8IZU9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KIRREL3Q8IZU9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIRREL3Q8IZU9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIRREL3Q8IZU9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIRREL3Q8IZU9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIRREL3Q8IZU9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIRREL3Q8IZU9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIRREL3Q8IZU9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms