Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PRAG1Q86YV5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRAG1Q86YV5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRAG1Q86YV5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRAG1Q86YV5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRAG1Q86YV5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
PRAG1Q86YV5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRAG1Q86YV5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PRAG1Q86YV5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PRAG1Q86YV5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PRAG1Q86YV5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PRAG1Q86YV5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
PRAG1Q86YV5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PRAG1Q86YV5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PRAG1Q86YV5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRAG1Q86YV5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRAG1Q86YV5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRAG1Q86YV5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRAG1Q86YV5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PRAG1Q86YV5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PRAG1Q86YV5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRAG1Q86YV5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
PRAG1Q86YV5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PRAG1Q86YV5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRAG1Q86YV5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRAG1Q86YV5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRAG1Q86YV5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRAG1Q86YV5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRAG1Q86YV5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRAG1Q86YV5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRAG1Q86YV5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRAG1Q86YV5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRAG1Q86YV5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRAG1Q86YV5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRAG1Q86YV5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRAG1Q86YV5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRAG1Q86YV5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRAG1Q86YV5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRAG1Q86YV5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRAG1Q86YV5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PRAG1Q86YV5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PRAG1Q86YV5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRAG1Q86YV5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRAG1Q86YV5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRAG1Q86YV5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRAG1Q86YV5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRAG1Q86YV5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRAG1Q86YV5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRAG1Q86YV5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRAG1Q86YV5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRAG1Q86YV5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRAG1Q86YV5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRAG1Q86YV5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRAG1Q86YV5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRAG1Q86YV5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRAG1Q86YV5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRAG1Q86YV5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms