Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
PPARGC1BQ86YN6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PPARGC1BQ86YN6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
PPARGC1BQ86YN6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
PPARGC1BQ86YN6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
PPARGC1BQ86YN6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
PPARGC1BQ86YN6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PPARGC1BQ86YN6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PPARGC1BQ86YN6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PPARGC1BQ86YN6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PPARGC1BQ86YN6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PPARGC1BQ86YN6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PPARGC1BQ86YN6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
PPARGC1BQ86YN6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
PPARGC1BQ86YN6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PPARGC1BQ86YN6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PPARGC1BQ86YN6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.07■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
PPARGC1BQ86YN6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC40.05■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.05■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.04■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PPARGC1BQ86YN6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms