Protein–RNA interactions for Protein: Q86W54

SPATA24, Spermatogenesis-associated protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA24Q86W54 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA24Q86W54 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA24Q86W54 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA24Q86W54 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA24Q86W54 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms