Protein–RNA interactions for Protein: Q86UK0

ABCA12, ATP-binding cassette sub-family A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA12Q86UK0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCA12Q86UK0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCA12Q86UK0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCA12Q86UK0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCA12Q86UK0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms