Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LDB1Q86U70 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LDB1Q86U70 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LDB1Q86U70 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms