Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00523Q86TU6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00523Q86TU6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00523Q86TU6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00523Q86TU6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00523Q86TU6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00523Q86TU6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00523Q86TU6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00523Q86TU6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00523Q86TU6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00523Q86TU6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00523Q86TU6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00523Q86TU6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00523Q86TU6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00523Q86TU6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00523Q86TU6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00523Q86TU6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms