Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMC6Q7Z403 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC6Q7Z403 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMC6Q7Z403 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMC6Q7Z403 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMC6Q7Z403 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms