Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC3Q7RTR2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC3Q7RTR2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC3Q7RTR2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms