Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BEND4Q6ZU67 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEND4Q6ZU67 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND4Q6ZU67 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms