Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIAA0408Q6ZU52 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KIAA0408Q6ZU52 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIAA0408Q6ZU52 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KIAA0408Q6ZU52 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIAA0408Q6ZU52 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIAA0408Q6ZU52 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIAA0408Q6ZU52 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIAA0408Q6ZU52 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIAA0408Q6ZU52 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIAA0408Q6ZU52 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KIAA0408Q6ZU52 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIAA0408Q6ZU52 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIAA0408Q6ZU52 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KIAA0408Q6ZU52 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIAA0408Q6ZU52 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KIAA0408Q6ZU52 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIAA0408Q6ZU52 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIAA0408Q6ZU52 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIAA0408Q6ZU52 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIAA0408Q6ZU52 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIAA0408Q6ZU52 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIAA0408Q6ZU52 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms