Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
UBR3Q6ZT12 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
UBR3Q6ZT12 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
UBR3Q6ZT12 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
UBR3Q6ZT12 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
UBR3Q6ZT12 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
UBR3Q6ZT12 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
UBR3Q6ZT12 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
UBR3Q6ZT12 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
UBR3Q6ZT12 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
UBR3Q6ZT12 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
UBR3Q6ZT12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
UBR3Q6ZT12 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
UBR3Q6ZT12 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
UBR3Q6ZT12 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
UBR3Q6ZT12 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
UBR3Q6ZT12 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
UBR3Q6ZT12 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
UBR3Q6ZT12 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
UBR3Q6ZT12 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
UBR3Q6ZT12 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
UBR3Q6ZT12 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
UBR3Q6ZT12 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
UBR3Q6ZT12 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
UBR3Q6ZT12 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
UBR3Q6ZT12 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
UBR3Q6ZT12 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
UBR3Q6ZT12 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
UBR3Q6ZT12 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
UBR3Q6ZT12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms