Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00575Q6W349 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00575Q6W349 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00575Q6W349 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms