Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LARP1Q6PKG0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LARP1Q6PKG0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LARP1Q6PKG0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LARP1Q6PKG0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LARP1Q6PKG0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LARP1Q6PKG0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LARP1Q6PKG0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LARP1Q6PKG0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
LARP1Q6PKG0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LARP1Q6PKG0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LARP1Q6PKG0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
LARP1Q6PKG0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LARP1Q6PKG0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LARP1Q6PKG0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
LARP1Q6PKG0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LARP1Q6PKG0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
LARP1Q6PKG0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
LARP1Q6PKG0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LARP1Q6PKG0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
LARP1Q6PKG0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LARP1Q6PKG0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LARP1Q6PKG0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
LARP1Q6PKG0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LARP1Q6PKG0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LARP1Q6PKG0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LARP1Q6PKG0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LARP1Q6PKG0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LARP1Q6PKG0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LARP1Q6PKG0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LARP1Q6PKG0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LARP1Q6PKG0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LARP1Q6PKG0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LARP1Q6PKG0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LARP1Q6PKG0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LARP1Q6PKG0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
LARP1Q6PKG0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LARP1Q6PKG0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LARP1Q6PKG0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LARP1Q6PKG0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LARP1Q6PKG0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LARP1Q6PKG0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LARP1Q6PKG0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LARP1Q6PKG0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LARP1Q6PKG0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LARP1Q6PKG0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LARP1Q6PKG0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms