Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM53Q6P2H8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM53Q6P2H8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms