Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC18B1Q6NT16 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC18B1Q6NT16 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18B1Q6NT16 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC18B1Q6NT16 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms