Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPRIN2Q6IMN6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPRIN2Q6IMN6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPRIN2Q6IMN6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPRIN2Q6IMN6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms