Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM225Q6GV28 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM225Q6GV28 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM225Q6GV28 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms