Protein–RNA interactions for Protein: Q643R3

LPCAT4, Lysophospholipid acyltransferase LPCAT4, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4Q643R3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LPCAT4Q643R3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LPCAT4Q643R3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPCAT4Q643R3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPCAT4Q643R3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPCAT4Q643R3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPCAT4Q643R3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPCAT4Q643R3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPCAT4Q643R3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LPCAT4Q643R3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT4Q643R3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT4Q643R3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT4Q643R3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT4Q643R3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT4Q643R3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT4Q643R3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT4Q643R3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPCAT4Q643R3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms