Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRAGBQ5VZM2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRAGBQ5VZM2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRAGBQ5VZM2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGBQ5VZM2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGBQ5VZM2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGBQ5VZM2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGBQ5VZM2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGBQ5VZM2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGBQ5VZM2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRAGBQ5VZM2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRAGBQ5VZM2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRAGBQ5VZM2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RRAGBQ5VZM2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RRAGBQ5VZM2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRAGBQ5VZM2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRAGBQ5VZM2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms