Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf140Q5VVS0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf140Q5VVS0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf140Q5VVS0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms