Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM69BQ5VUD6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM69BQ5VUD6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM69BQ5VUD6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM69BQ5VUD6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM69BQ5VUD6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM69BQ5VUD6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM69BQ5VUD6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM69BQ5VUD6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM69BQ5VUD6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM69BQ5VUD6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM69BQ5VUD6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM69BQ5VUD6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM69BQ5VUD6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM69BQ5VUD6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM69BQ5VUD6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM69BQ5VUD6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM69BQ5VUD6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM69BQ5VUD6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM69BQ5VUD6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM69BQ5VUD6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM69BQ5VUD6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM69BQ5VUD6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM69BQ5VUD6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM69BQ5VUD6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM69BQ5VUD6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms