Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEF5Q5TYX0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF5Q5TYX0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms