Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIVEP3Q5T1R4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIVEP3Q5T1R4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIVEP3Q5T1R4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIVEP3Q5T1R4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIVEP3Q5T1R4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIVEP3Q5T1R4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIVEP3Q5T1R4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIVEP3Q5T1R4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIVEP3Q5T1R4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIVEP3Q5T1R4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIVEP3Q5T1R4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms