Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1Q4

SLC35F1, Solute carrier family 35 member F1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F1Q5T1Q4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC35F1Q5T1Q4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35F1Q5T1Q4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35F1Q5T1Q4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35F1Q5T1Q4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms