Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
WDR44Q5JSH3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
WDR44Q5JSH3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR44Q5JSH3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR44Q5JSH3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.57■■■□□ 2
WDR44Q5JSH3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR44Q5JSH3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR44Q5JSH3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WDR44Q5JSH3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WDR44Q5JSH3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.56■■■□□ 2
WDR44Q5JSH3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WDR44Q5JSH3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.54■■■□□ 2
WDR44Q5JSH3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WDR44Q5JSH3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
WDR44Q5JSH3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms