Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TDRD12Q587J7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD12Q587J7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TDRD12Q587J7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TDRD12Q587J7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD12Q587J7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms