Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFT2D3Q587I9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFT2D3Q587I9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFT2D3Q587I9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SFT2D3Q587I9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SFT2D3Q587I9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms