Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FNDC1Q4ZHG4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FNDC1Q4ZHG4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FNDC1Q4ZHG4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FNDC1Q4ZHG4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms