Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF6Q330K2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDUFAF6Q330K2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms