Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AP5B1Q2VPB7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP5B1Q2VPB7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP5B1Q2VPB7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP5B1Q2VPB7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP5B1Q2VPB7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP5B1Q2VPB7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP5B1Q2VPB7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP5B1Q2VPB7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AP5B1Q2VPB7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP5B1Q2VPB7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP5B1Q2VPB7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP5B1Q2VPB7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP5B1Q2VPB7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP5B1Q2VPB7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP5B1Q2VPB7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP5B1Q2VPB7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1205.2 ms