Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDO1Q16878 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDO1Q16878 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDO1Q16878 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDO1Q16878 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CDO1Q16878 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDO1Q16878 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDO1Q16878 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDO1Q16878 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDO1Q16878 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDO1Q16878 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDO1Q16878 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDO1Q16878 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDO1Q16878 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDO1Q16878 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDO1Q16878 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
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