Protein–RNA interactions for Protein: Q16820

MEP1B, Meprin A subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEP1BQ16820 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEP1BQ16820 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEP1BQ16820 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEP1BQ16820 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEP1BQ16820 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms