Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NRF1Q16656 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRF1Q16656 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRF1Q16656 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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