Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TBR1Q16650 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TBR1Q16650 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TBR1Q16650 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBR1Q16650 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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