Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACKR1Q16570 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACKR1Q16570 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACKR1Q16570 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACKR1Q16570 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms