Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX1Q16384 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX1Q16384 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX1Q16384 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX1Q16384 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX1Q16384 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX1Q16384 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX1Q16384 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX1Q16384 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX1Q16384 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX1Q16384 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX1Q16384 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX1Q16384 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX1Q16384 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSX1Q16384 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX1Q16384 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX1Q16384 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX1Q16384 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX1Q16384 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX1Q16384 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX1Q16384 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX1Q16384 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX1Q16384 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX1Q16384 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX1Q16384 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX1Q16384 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX1Q16384 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX1Q16384 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX1Q16384 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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