Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.49
LAMA4Q16363 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LAMA4Q16363 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LAMA4Q16363 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LAMA4Q16363 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LAMA4Q16363 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LAMA4Q16363 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LAMA4Q16363 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LAMA4Q16363 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LAMA4Q16363 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LAMA4Q16363 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LAMA4Q16363 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LAMA4Q16363 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LAMA4Q16363 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LAMA4Q16363 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMA4Q16363 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
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