Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1EQ15878 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1EQ15878 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1EQ15878 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1EQ15878 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1EQ15878 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1EQ15878 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1EQ15878 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1EQ15878 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1EQ15878 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1EQ15878 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1EQ15878 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA1EQ15878 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1EQ15878 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1EQ15878 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1EQ15878 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms