Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDK3Q15120 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDK3Q15120 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDK3Q15120 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDK3Q15120 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDK3Q15120 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDK3Q15120 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDK3Q15120 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDK3Q15120 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDK3Q15120 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDK3Q15120 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDK3Q15120 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDK3Q15120 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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