Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL19A1Q14993 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL19A1Q14993 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL19A1Q14993 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL19A1Q14993 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms