Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAT1Q14517 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAT1Q14517 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FAT1Q14517 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FAT1Q14517 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FAT1Q14517 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAT1Q14517 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAT1Q14517 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAT1Q14517 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAT1Q14517 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAT1Q14517 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAT1Q14517 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FAT1Q14517 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAT1Q14517 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAT1Q14517 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FAT1Q14517 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAT1Q14517 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAT1Q14517 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAT1Q14517 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FAT1Q14517 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FAT1Q14517 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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FAT1Q14517 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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