Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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