Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P11Q13670 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P11Q13670 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMS2P11Q13670 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms