Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNASE1L3Q13609 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNASE1L3Q13609 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNASE1L3Q13609 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNASE1L3Q13609 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNASE1L3Q13609 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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