Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 MIB2-223ENST00000508148 577 ntTSL 414.91□□□□□ -0.026e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 PNCK-219ENST00000463548 783 ntTSL 514.82□□□□□ -0.046e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.066e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 IMPDH1-216ENST00000497868 952 ntTSL 514.68□□□□□ -0.066e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 IMPDH1-211ENST00000484496 2422 ntTSL 514.68□□□□□ -0.066e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.096e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 AACS-211ENST00000543665 2272 ntTSL 214.49□□□□□ -0.096e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.16e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.16e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.116e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 PNCK-210ENST00000425526 725 ntTSL 514.24□□□□□ -0.136e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 PRELID3A-204ENST00000587862 580 ntTSL 513.92□□□□□ -0.186e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 ENDOV-227ENST00000523228 545 ntTSL 413.77□□□□□ -0.216e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 BTBD19-206ENST00000482715 558 ntTSL 413.76□□□□□ -0.216e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 PRELID3A-206ENST00000589565 777 ntTSL 313.7□□□□□ -0.226e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 IMPDH1-212ENST00000489263 598 ntTSL 313.61□□□□□ -0.236e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.236e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 PRELID3A-207ENST00000589952 488 ntTSL 413.58□□□□□ -0.246e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 ENDOV-214ENST00000520484 508 ntTSL 413.47□□□□□ -0.256e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.256e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.256e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.276e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.276e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.286e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 ENDOV-228ENST00000523828 607 ntTSL 513.31□□□□□ -0.286e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 PLCG1-207ENST00000473632 412 ntTSL 513.16□□□□□ -0.36e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 FTSJ1-213ENST00000496365 1287 ntTSL 513.09□□□□□ -0.316e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 PNCK-232ENST00000489536 836 ntTSL 213.03□□□□□ -0.326e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 RPL3-216ENST00000484358 557 ntTSL 212.98□□□□□ -0.336e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 NEK1-201ENST00000439128 5653 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.336e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 PNCK-214ENST00000439087 754 ntTSL 512.82□□□□□ -0.366e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 ORC6-203ENST00000563599 681 ntTSL 512.52□□□□□ -0.416e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 ENDOV-219ENST00000521565 547 ntTSL 412.44□□□□□ -0.426e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 RTFDC1-204ENST00000449062 852 ntTSL 512.43□□□□□ -0.426e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 ORC6-204ENST00000566860 1699 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.446e-9■■■■■ 59.3
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SF3A3Q12874 NEK1-206ENST00000510533 5377 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.546e-9■■■■■ 59.3
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SF3A3Q12874 PNCK-205ENST00000411968 557 ntTSL 59.88□□□□□ -0.836e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 NEK1-203ENST00000507142 5556 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.856e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.926e-9■■■■■ 59.3
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SF3A3Q12874 ENDOV-216ENST00000520565 433 ntTSL 59.13□□□□□ -0.956e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.986e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 BCAP31-205ENST00000430088 570 ntTSL 28.2□□□□□ -1.16e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.116e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 OBSL1-210ENST00000472388 625 ntTSL 27.96□□□□□ -1.146e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 PLEKHH1-204ENST00000558296 605 ntTSL 47.77□□□□□ -1.176e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 FTSJ1-204ENST00000466371 736 ntTSL 26.81□□□□□ -1.326e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.37□□□□□ -1.716e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.69□□□□□ -1.826e-9■■■■■ 59.3
SF3A3Q12874 PHIP-202ENST00000479165 5694 ntTSL 1 (best)1.64□□□□□ -2.155e-7■■■■■ 59.1
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SF3A3Q12874 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.11e-60■■■■■ 58.9
SF3A3Q12874 EVL-204ENST00000553694 890 ntTSL 213.73□□□□□ -0.211e-60■■■■■ 58.9
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SF3A3Q12874 EVL-217ENST00000555848 1547 ntTSL 1 (best)13.28□□□□□ -0.281e-60■■■■■ 58.9
SF3A3Q12874 EVL-209ENST00000554031 819 ntTSL 512.51□□□□□ -0.411e-60■■■■■ 58.9
SF3A3Q12874 EVL-219ENST00000556258 567 ntTSL 212.45□□□□□ -0.421e-60■■■■■ 58.9
SF3A3Q12874 PPP6R1-207ENST00000591602 520 ntTSL 514.77□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 DDX5-205ENST00000577922 996 ntTSL 516.31■□□□□ 0.26e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.136e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 DDX5-220ENST00000581806 576 ntTSL 414.94□□□□□ -0.026e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 DDX5-219ENST00000581697 580 ntTSL 514.77□□□□□ -0.056e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.246e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-203ENST00000420199 1002 ntTSL 312.92□□□□□ -0.346e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 PSRC1-211ENST00000474126 366 ntTSL 312.78□□□□□ -0.366e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.466e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-209ENST00000435947 696 ntTSL 212.08□□□□□ -0.486e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-215ENST00000623163 851 ntTSL 511.74□□□□□ -0.536e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-212ENST00000589187 568 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.596e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-210ENST00000453754 401 ntTSL 310.26□□□□□ -0.776e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-206ENST00000428833 641 ntTSL 210.24□□□□□ -0.776e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.926e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-207ENST00000431043 998 ntTSL 29.17□□□□□ -0.946e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-220ENST00000624128 672 ntTSL 28.49□□□□□ -1.056e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-202ENST00000414002 430 ntTSL 28.19□□□□□ -1.16e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-218ENST00000623901 711 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.176e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-217ENST00000623650 886 ntTSL 57.72□□□□□ -1.176e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 DDX5-206ENST00000578190 582 ntTSL 37.35□□□□□ -1.236e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-204ENST00000425170 489 ntTSL 26.51□□□□□ -1.376e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.396e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.476e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-216ENST00000623267 374 ntTSL 55.68□□□□□ -1.56e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.56e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 DDX5-225ENST00000583562 465 ntTSL 1 (best)5.41□□□□□ -1.546e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 SNHG5-208ENST00000433843 388 ntTSL 21.87□□□□□ -2.116e-10■■■■■ 58.7
SF3A3Q12874 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)21.51■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 58.2
SF3A3Q12874 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 58.2
SF3A3Q12874 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 58.2
SF3A3Q12874 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 58.2
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