RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.11■■■■■ 4.01
TTLL3-210ENST00000427220 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.54■■■■□ 3.28
TTLL3-210ENST00000427220 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.23■■■■□ 3.23
TTLL3-210ENST00000427220 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
TTLL3-210ENST00000427220 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.51■■■□□ 2.96
TTLL3-210ENST00000427220 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.07■■■□□ 2.88
TTLL3-210ENST00000427220 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.71■■■□□ 2.83
TTLL3-210ENST00000427220 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.71■■■□□ 2.83
TTLL3-210ENST00000427220 ABCC9O60706 1549 aa32.69■■■□□ 2.82
TTLL3-210ENST00000427220 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.63■■■□□ 2.81
TTLL3-210ENST00000427220 SCRIBQ14160 1630 aa32.45■■■□□ 2.79
TTLL3-210ENST00000427220 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.78
TTLL3-210ENST00000427220 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.42■■■□□ 2.78
TTLL3-210ENST00000427220 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.25■■■□□ 2.75
TTLL3-210ENST00000427220 TRIM41Q8WV44 630 aa32.07■■■□□ 2.72
TTLL3-210ENST00000427220 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
TTLL3-210ENST00000427220 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.79■■■□□ 2.68
TTLL3-210ENST00000427220 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
TTLL3-210ENST00000427220 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.7■■■□□ 2.672e-6■■□□□ 13.1
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TTLL3-210ENST00000427220 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.57■■■□□ 2.64
TTLL3-210ENST00000427220 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
TTLL3-210ENST00000427220 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.44■■■□□ 2.62
TTLL3-210ENST00000427220 NACADO15069 1562 aa31.39■■■□□ 2.62
TTLL3-210ENST00000427220 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
TTLL3-210ENST00000427220 WIZO95785 1651 aa31.22■■■□□ 2.59
TTLL3-210ENST00000427220 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
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TTLL3-210ENST00000427220 ABCC8Q09428 1581 aa30.76■■■□□ 2.51
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.67■■■□□ 2.5
TTLL3-210ENST00000427220 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
TTLL3-210ENST00000427220 SOGA1O94964 1423 aa30.53■■■□□ 2.48
TTLL3-210ENST00000427220 SMARCA4P51532 1647 aa30.51■■■□□ 2.47
TTLL3-210ENST00000427220 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
TTLL3-210ENST00000427220 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.42■■■□□ 2.46
TTLL3-210ENST00000427220 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
TTLL3-210ENST00000427220 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.4■■■□□ 2.46
TTLL3-210ENST00000427220 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.38■■■□□ 2.45
TTLL3-210ENST00000427220 SMARCA2P51531 1590 aa30.32■■■□□ 2.44
TTLL3-210ENST00000427220 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
TTLL3-210ENST00000427220 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.22■■■□□ 2.43
TTLL3-210ENST00000427220 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
TTLL3-210ENST00000427220 CEP162Q5TB80 1403 aa30.15■■■□□ 2.42
TTLL3-210ENST00000427220 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.41
TTLL3-210ENST00000427220 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
TTLL3-210ENST00000427220 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
TTLL3-210ENST00000427220 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.01■■■□□ 2.39
TTLL3-210ENST00000427220 APLP2Q06481 763 aa30■■■□□ 2.39
TTLL3-210ENST00000427220 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.88■■■□□ 2.37
TTLL3-210ENST00000427220 GOLGA3Q08378 1498 aa29.77■■■□□ 2.36
TTLL3-210ENST00000427220 SYNJ1O43426 1573 aa29.77■■■□□ 2.36
TTLL3-210ENST00000427220 ITGAEP38570 1179 aa29.71■■■□□ 2.35
TTLL3-210ENST00000427220 CLIP1P30622 1438 aa29.7■■■□□ 2.35
TTLL3-210ENST00000427220 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
TTLL3-210ENST00000427220 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.66■■■□□ 2.34
TTLL3-210ENST00000427220 EEA1Q15075 1411 aa29.65■■■□□ 2.34
TTLL3-210ENST00000427220 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.56■■■□□ 2.32
TTLL3-210ENST00000427220 P3H3Q8IVL6 736 aa29.54■■■□□ 2.32
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TTLL3-210ENST00000427220 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
TTLL3-210ENST00000427220 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.45■■■□□ 2.31
TTLL3-210ENST00000427220 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
TTLL3-210ENST00000427220 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.29■■■□□ 2.28
TTLL3-210ENST00000427220 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
TTLL3-210ENST00000427220 NCAPD3P42695 1498 aa29.25■■■□□ 2.27
TTLL3-210ENST00000427220 KIF27Q86VH2 1401 aa29.2■■■□□ 2.26
TTLL3-210ENST00000427220 CUX1P39880 1505 aa29.19■■■□□ 2.26
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
TTLL3-210ENST00000427220 NEUROD1Q13562 356 aa29.16■■■□□ 2.26
TTLL3-210ENST00000427220 CUX2O14529 1486 aa29.16■■■□□ 2.26
TTLL3-210ENST00000427220 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.16■■■□□ 2.26
TTLL3-210ENST00000427220 KIF21BO75037 1637 aa29.14■■■□□ 2.26
TTLL3-210ENST00000427220 TOP2BQ02880 1626 aa29.14■■■□□ 2.25
TTLL3-210ENST00000427220 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
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TTLL3-210ENST00000427220 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.03■■■□□ 2.24
TTLL3-210ENST00000427220 ARAP1Q96P48 1450 aa29.01■■■□□ 2.23
TTLL3-210ENST00000427220 MIER1Q8N108 512 aa28.98■■■□□ 2.23
TTLL3-210ENST00000427220 PRXQ9BXM0 1461 aa28.98■■■□□ 2.23
TTLL3-210ENST00000427220 ARID3CA6NKF2 412 aa28.98■■■□□ 2.23
TTLL3-210ENST00000427220 HMGXB3Q12766 1538 aa28.96■■■□□ 2.23
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TTLL3-210ENST00000427220 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
TTLL3-210ENST00000427220 IGF1RP08069 1367 aa28.94■■■□□ 2.22
TTLL3-210ENST00000427220 NESP48681 1621 aa28.94■■■□□ 2.22
TTLL3-210ENST00000427220 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.93■■■□□ 2.22
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TTLL3-210ENST00000427220 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.87■■■□□ 2.21
TTLL3-210ENST00000427220 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.84■■■□□ 2.21
TTLL3-210ENST00000427220 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.81■■■□□ 2.2
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.79■■■□□ 2.2
TTLL3-210ENST00000427220 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
TTLL3-210ENST00000427220 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.78■■■□□ 2.2
TTLL3-210ENST00000427220 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.7■■■□□ 2.19
TTLL3-210ENST00000427220 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
TTLL3-210ENST00000427220 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.69■■■□□ 2.18
TTLL3-210ENST00000427220 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.68■■■□□ 2.18
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